28 апреля 1942 года Управление внутренних войск НКВД СССР реорганизовано в Главное управление внутренних войск.

В его состав вошло Управление войск НКВД по охране тыла действующей Красной Армии.

25 июня 1941 года Совет народных комиссаров СССР принял

постановление о возложении задач по охране тыла действующей Красной Армии

на НКВД. Основу войск по охране тыла составляли пограничные войска (порядка

70%). Задачами войск по охране тыла были: борьба со шпионажем, диверсиями и

бандитизмом. дезертирством и мародерством; уничтожение мелких групп

противника, просочившихся в тыл действующей армии; сбор трофейного и

оставленного в тылу войск военного имущества.

Весной 1943 года численность войск по охране тыла составляла более 62

тысяч человек личного состава.

В 1944–1945 годах войска по охране тыла в Прибалтике вели борьбу с

националистическим подпольем – «лесными братьями», на Западной Украине с

Украинской повстанческой армией, а на территории Польши – с Армией

Крайовой.