25 июня 1941 года Совет народных комиссаров СССР принял
постановление о возложении задач по охране тыла действующей Красной Армии
на НКВД. Основу войск по охране тыла составляли пограничные войска (порядка
70%). Задачами войск по охране тыла были: борьба со шпионажем, диверсиями и
бандитизмом. дезертирством и мародерством; уничтожение мелких групп
противника, просочившихся в тыл действующей армии; сбор трофейного и
оставленного в тылу войск военного имущества.
Весной 1943 года численность войск по охране тыла составляла более 62
тысяч человек личного состава.
В 1944–1945 годах войска по охране тыла в Прибалтике вели борьбу с
националистическим подпольем – «лесными братьями», на Западной Украине с
Украинской повстанческой армией, а на территории Польши – с Армией
Крайовой.